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Tipo: Dissertação
Título: Métodos de agrupamento: avaliação e aplicação ao estudo de divergência genética em acessos de alho
Título(s) alternativo(s): Clustering methods: evaluation and application for study of genetic divergence in garlic accessions
Autor(es): Silva, Anderson Rodrigo da
Primeiro Orientador: Cecon, Paulo Roberto
Primeiro coorientador: Carneiro, Antônio Policarpo Souza
Segundo coorientador: Silva, Fabyano Fonseca e
Primeiro avaliador: Ferreira, Adésio
Segundo avaliador: Martins Filho, Sebastião
Terceiro avaliador: Nascimento, Moysés
Abstract: Este estudo teve por objetivo avaliar, quanto a consistência do agrupamento, os métodos de agrupamentos hierárquicos UPGMA e Ward e os de otimização de Tocher e Tocher modificado, pela aplicação da análise discriminante de Fisher aos grupos obtidos com cada método, em estudo da divergência genética entre acessos de alho, identificando também os acessos mais dissimilares. Os agrupamentos foram realizados com base na distância generalizada de Mahalanobis, que também permitiu quantificar a importância relativa dos caracteres. Os acessos que apresentaram maior dissimilaridade foram os acessos 13 (BGH 4505) e 61 (BGH 5958), principalmente em relação ao peso médio do bulbo e produtividade. Os métodos de Tocher modificado, UPGMA e algoritmo de Ward apresentaram resultados concordantes entre si quanto a formação dos grupos. No entanto, pela análise discriminante de Fisher aplicada aos grupos dos métodos hierárquicos (UPGMA e Ward) observou-se as menores taxas de erro aparente, sendo, portanto, os métodos mais consistentes para o estudo da diversidade genética de acessos de alho.
This study aimed to assess, as the consistency of the grouping, hierarchical clustering methods UPGMA and Ward and optimization Tocher and modified Tocher by application of Fisher discriminant analysis in groups obtained with each method in the study of genetic divergence among garlic accessions, also identifying the most dissimilar access. The groupings were based on the Mahalanobis distance, which also allowed to quantify the relative importance of characters. The accessions with the highest dissimilarity accesses were 13 (BGH 4505) and 61 (BGH 5958), especially in relation to the average weight of the bulb and productivity. Modified Tocher methods, UPGMA and Ward algorithm presented results agree with each other and form groups. However, the Fisher discriminant analysis applied to groups of hierarchical methods (UPGMA and Ward) showed the lowest apparent error, therefore, more consistent methods for studying the genetic diversity of garlic accessions.
Palavras-chave: Allium sativum L.
Análise de cluster
Análise discriminante
Allium sativum L.
Cluster analysis
Discriminant analysis
CNPq: CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
Idioma: por
País: BR
Editor: Universidade Federal de Viçosa
Sigla da Instituição: UFV
Departamento: Estatística Aplicada e Biometria
Programa: Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria
Citação: SILVA, Anderson Rodrigo da. Clustering methods: evaluation and application for study of genetic divergence in garlic accessions. 2012. 83 f. Dissertação (Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2012.
Tipo de Acesso: Acesso Aberto
URI: http://locus.ufv.br/handle/123456789/4045
Data do documento: 13-Fev-2012
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