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Tipo: Tese
Título: Identificação de parceiros de interação para a cinease reguladora de splicing SRPK2
Idetification of interaction mates for the splicing regulator kinase SRPK2
Autor(es): Mello, Aline Oliveira
Abstract: Serine-Arginine Protein Kinase 2 - SRPK2 é uma cinase reguladora de fatores de splicing não-snRNPs (proteínas SR), e de fatores snRNPs (U4⁄U6-U5 tri-snRNP). SRPK2 regula as proteínas SR fosforilando-as em seus resíduos de serina e recrutando- as para a formação do spliceossomo, enquanto atua na formação do complexo U4⁄U6- U5 tri-snRNP, envolvido na seleção do sítio de splicing γ’. As interações com fatores snRNP e não-snRNP são conhecidas e bem estabelecidas funcionalmente, no entanto, pouco se sabe sobre proteínas que regulam o funcionamento da SRPK2, e sobre demais alvos de fosforilação. As proteínas SRPKs possuem seu domínio cinase divido em dois por uma região espaçadora de grande flexibilidade estrutural, passível de interação. Portanto, possível responsável pela seleção de substratos e/ou alvo de regulação. Nosso objetivo com este trabalho foi encontrar novas interações proteicas de SRPK2 através de sua região espaçadora. A técnica escolhida foi o duplo-híbrido em leveduras, no qual estas foram cotransformadas com o plasmídeo pBTM116K/S-SRPK2 trp1 e com uma biblioteca de cDNAs de leucócitos humanos em pACT2 leu2. O experimento foi processado em meio restritivo SD–TRP –LEU –HIS, acrescido de 30mM de 3AT e mantido em estufa 30°C por 120 horas. Ao final deste período, foi verificado o crescimento de 119 colônias de leveduras, submetidas a diferentes testes de ativação dos genes repórteres his3 e lacZ. Os resultados destes testes nos levaram a seleção de 42 clones, que tiveram seus DNAs plasmidiais extraídos, sequenciados e analisados pela ferramenta Blast do NCBI. As proteínas codificadas por estes genes estão funcionalmente relacionadas a processos celulares como biogênese ribossomal, migração, diferenciação, angiogênese, proliferação, sobrevivência e ciclo celular. Estes resultados sugerem novos mecanismos moleculares para a atuação da SRPK2 no processo tumorigênico.
Serine-Arginine Protein Kinase 2 - SRPK2 is a regulator kinase of non-snRNP splicing factors (SR proteins) and of snRNPs factors (U4⁄U6-U5 tri-snRNP). SRPK2 regulates SR proteins phosphorylating them on their serine and recruiting them for the formation of the spliceosome, while acts on the tri-snRNP U4/U6-U5 complex assembly, involved in the splicing γ’ site selection. The interactions with snRNP and non-snRNP factors are known and well-established functionally, however, little is known about the proteins that regulate the functioning of SRPK2, and about other targets of phosphorylation. The SRPKs proteins have their kinase domain divided into two by a spacer region of great structural flexibility, believable of interaction. Therefore, possible responsible for selection of substrates and/or aim of regulation. Our aim with this work was to find new protein interactions of SRPK2 by its space region. The technique chose was two-hybrid yeast, in which yeasts were cotransfected with pBTM116K/S-SRPK2 trp1 plasmid and a human leukocyte cDNA library in pACT2 leu2. The experiment was processed in restrictive medium SD –TRP –LEU –HIS, plus 30 mM of 3AT and keep in a incubator 30°C for 120 hours. At the end of this period, it was found the growth of 119 yeast colonies, subjected a different tests of activation of reporter genes his3 and lacZ. The results of these tests led to the selection of 42 clones, which had its plasmid DNA extracted, sequenced and analyzed by the NCBI Blast tool. The proteins encoded by these genes are functionally related in cellular processes as ribosome biogenesis, migration, differentiation, angiogenesis, proliferation, survival and cell cycle. These results suggest new molecular mechanisms for the performance of SRPK2 in tumorigenic process.
Palavras-chave: Biologia celular
Proteínas
SRPK2
Splicing
CNPq: Biologia Geral
Editor: Universidade Federal de Viçosa
Citação: MELLO, Aline Oliveira. Identificação de parceiros de interação para a cinease reguladora de splicing SRPK2. 2014. 81 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Estrutural) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2014.
Tipo de Acesso: Acesso Aberto
URI: http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/6631
Data do documento: 19-Ago-2014
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