Análise comparativa do perfil transcricional do concepto suíno de dois grupos genéticos em diferentes etapas do desenvolvimento

Abstract

O conhecimento dos processos que ocorrem durante o desenvolvimento do animal é de extrema importância para a identificação de possíveis problemas ocorridos durante a gestação, para garantir o perfeito desenvolvimento do animal, saber o seu total potencial na idade adulta e evitar problemas futuros e perdas embrionárias. Assim, este estudo teve como objetivo avaliar o desenvolvimento gestacional analisando os principais processos biológicos dos genes mais expressos entre dois grupos genéticos, sendo um grupo composto pela linhagem comercial e outro grupo de raça nativa Piau nos períodos gestacionais 21, 40, 70 e 90 dias pós concepção (dpc). Deste modo, espera-se um melhor entendimento biológico dos genes mais expressos durante o desenvolvimento embrionário e fetal entre uma linhagem com anos de melhoramento genético e uma raça nativa local. Os dados fornecidos foram previamente tratados, onde destes, os top 1% dos genes de cada idade contendo maior número de pedaços do genoma foram utilizados para as análises de processos biológicos. Para finalizar, comparamos os resultados entre as idades de cada grupo genético, a fim de apresentar as diferenças entre os processos biológicos encontrados em cada idade observada ao longo do período gestacional e elucidar as diferenças entre os grupos através dos processos biológicos associados aos diferentes genes encontrados dentro de cada idade. Apenas processos biológicos enriquecidos com número superior a 9 genes foram selecionados para análises. Após análise dos principais genes expressos de cada grupo genético, observamos um total de 121 e 72 genes ao longo das idades e 12 e 8 processos biológicos para os grupos da linhagem comercial e Piau, respectivamente. Os resultados apresentados no presente estudo indicam algumas diferenças no desenvolvimento gestacional entre os animais do grupo genético comercial e raça local Piau entre as diferentes idades avaliadas. O grupo genético Comercial apresentou números maiores de processos biológicos e genes os enriquecendo em todas as idades. A presença de processos biológicos apenas para o grupo comercial na primeira idade avaliada nos mostra que o grupo pode estar apresentando o desenvolvimento precoce comparado com o Piau, além de o processo encontrado ser justamente relacionado com processos celulares, por ser responsável pela produção de energia. Na segunda idade avaliada, o Comercial apresentou todos os processos biológicos encontrados no outro grupo, mostrando não estar totalmente a frente no desenvolvimento, apesar de apresentar mais três processos biológicos que o grupo Piau. Estes processos apontam um desenvolvimento inicial nos tecidos, órgãos e sistemas, reforçado pela presença do próprio processo biológico de desenvolvimento dos órgãos (GO:0048513) exclusivamente no grupo Comercial, mostrando um adiantamento em relação ao grupo Piau. Entretanto, são necessárias novas pesquisas com maior número de fêmeas por idade e o aumento no número de idades amostradas para melhores avaliações sobre as diferenças entre estes grupos genéticos.

The knowlegde of occuring processes that occur during the development of the animal is extremely important for the identify possible problems during gestation, to ensure a perfect animal development, to know its fetal potential in adult age and avoid future problems and embryonic losses. The aim of this study was to evaluate gestational development by analyzing the main biological processes of the most expressed genes between two genetic groups, a composed of the commercial line and the native breed Piau in the gestational periods 21, 40, 70 and 90 days post conception (dpc). In the way, a better biological understanding of the most expressed genes is expected during embryonic and fetal development between a line with years of genetic improvement and a local native breed. The data were previously treated, in with the top 1% of the genes of each age containing the highest number of pieces of the genome were used for the biological process analyzes. In addiction, we compared the results between the ages of each genetic group in order to present the differences between the biological processes found in each age observed during the gestational period and to highlight the differences between the groups through the biological processes associated with the different genes found within each age. Only enriched biological processes with more than 9 genes were selected for analysis. After analysis of the main expressed genes of each genetic group, we observed a total of 121 and 72 genes along the ages and 12 and 8 biological processes for the commercial line and Piau groups, respectively. The results presented in the present study indicate some differences in the gestational development among the animals of the commercial genetic group and Piau local race among the different ages evaluated. The commercial genetic group presented higher numbers of biological processes and genes enriching them at all ages. The presence of biological processes only for the commercial group in the first evaluated age shows that this group may be presenting an early development compared to the Piau, besides the process found to be precisely related to cellular processes, being responsible for the energy production. In the second age evaluated, the commercial presented all the biological processes found in the other group, showing not to be totally forward in development, despite presenting three more biological processes than the Piau group. These processes point to an initial development in the tissues, organs and systems, reinforced by the presence of the biological process of organ development (GO: 0048513) exclusively in the Commercial group, showing an advance in relation to the Piau group. However, further research is needed with a higher number of females per age and higher number of ages sampled for better assessments of the differences between these genetic groups.