Detecção de Rhizoctonia solani e Sclerotinia sclerotiorum em sementes de feijão por meio da técnica de amplificação isotérmica mediada por loop (LAMP) e redução da viabilidade de escleródios de S. sclerotiorum pelo método de desinfestação anaeróbica do solo

Abstract

Sclerotinia sclerotiorum e Rhizoctonia solani causam prejuízos significativos à cultura do feijão. Esses fungos sobrevivem no solo na forma de escleródios e são dispersos a longa distâncias por meio de sementes. A detecção acurada de patógenos em sementes e a redução da viabilidade de estruturas de sobrevivência de fungos no campo podem contribuir para redução de perdas agrícolas. As hipóteses principais deste trabalho foram que a técnica de amplificação isotérmica mediada por loop (LAMP) poderia ser usada para detecção de S. sclerotiorum e R. solani em sementes de feijão e que o método de desinfestação anaeróbica do solo (DAS) reduziria a viabilidade de escleródios de S. sclerotiorum no campo. No Capítulo 1, objetivamos validar o protocolo de detecção de R. solani e S. sclerotiorum em sementes de feijoeiro comum por LAMP. Lotes de sementes livres desses patógenos, de sementes naturalmente infectadas e artificialmente infectadas foram usadas para validação da técnica. Rhizoctonia solani foi detectado em sementes em reação LAMP conduzida a 65o C por 60 minutos e, para S. sclerotiorum, a 63oC por 45 minutos. Assim, é possível concluir que LAMP pode ser usada para detecção rápida e acurada de R. solani e S. sclerotiorum em sementes de feijão infectadas. No Capítulo 2, avaliou-se o efeito da DAS por três semanas com farelo de soja, farelo de arroz e casca de soja, na dose de 9 ton/ha, na viabilidade de escleródios de S. sclerotiorum e de Stromatinia cepivora (para comparação) em condições de campo. A DAS com farelo de soja reduziu em 40% a viabilidade de escleródios de S. sclerotiorum e a de escleródios de S. cepivora em 52,5%. A DAS por três semanas reduz a viabilidade de escleródios de S. sclerotiorum, principalmente usando farelo de arroz como fonte de carbono. Palavras-chave: Controle de doenças de plantas. Desinfestação biológica do solo. Diagnose molecular. Mofo branco. Phaseolus vulgaris.

Sclerotinia sclerotiorum and Rhizoctonia solani cause significant damage to common bean. These fungi survive in the soil as sclerotia and are dispersed over long distances by seed. The accurate detection of seed pathogens and the reduction of the viability of fungal survival structures in the field can contribute to decrease agricultural losses. The main hypothesis of this work was that the loop- mediated isothermal amplification (LAMP) technique could be used for detection of S. sclerotiorum and R. solani in common bean seeds and that the anaerobic soil disinfestation (DAS) method would reduce the viability of S. sclerotiorum sclerotia in the field. In Chapter 1, we aimed to validate the detection protocol of R. solani and S. sclerotiorum in common bean seeds by LAMP. Lots of healthy seeds free, and seeds naturally and artificially infected with these fungi were used to validate the technique. Rhizoctonia solani was detected in seeds in LAMP reaction at 65oC for 60 minutes and, for S. sclerotiorum, at 63oC for 45 minutes. Thus, it can be concluded that LAMP can be used for rapid and accurate detection of R. solani and S. sclerotiorum in infected common bean seeds. In Chapter 2, the effect of DAS for three weeks with soybean bran, rice bran and soybean hulls, at 9 ton / ha, was evaluated on the viability of S. sclerotiorum and Stromatinia cepivora sclerotia (for comparison) under field conditions. DAS using rice bran reduced by 40% the viability of S. sclerotiorum sclerotia and of S. cepivora by 52.5%. DAS for three weeks reduces the viability of S. sclerotiorum sclerotia, mainly using rice bran as a carbon source. Keywords: Control of plant diseases. Anaerobic soil disinfestation. Molecular diagnostics. White mold. Phaseolus vulgaris.