Avaliação de três métodos de extração de DNA de Salmonella sp. em ovos de galinhas contaminados artificialmente

Abstract

Avaliou-se a eficiência de três protocolos para a extração de DNA genômico de bactérias do gênero Salmonella em ovos de galinhas livres de patógenos específicos – SPF. Foram utilizados 75 ovos, divididos em cinco grupos com 15 ovos cada. Três grupos de ovos foram inoculados com culturas de Salmonella sp. Um quarto grupo foi inoculado com cultura de Escherichia coli. O quinto grupo foi o controle negativo, que recebeu solução salina 0,85% estéril. Os ovos ficaram incubados na temperatura em torno de 20 - 25oC durante 24 horas. Após esse intervalo foram colhidas cinco gemas de cada grupo, as quais foram homogeneizadas e centrifugadas por 10 minutos; o sobrenadante resultante foi descartado. Após o descarte, adicionou-se PBS pH 7,2 e centrifugou-se novamente. O sedimento obtido de cada grupo foi utilizado para a extração do DNA genômico bacteriano. Os métodos utilizados de extração foram: por partículas de sílica e um kit comercial - GenElute Bacterial Genomic DNA kit. O DNA extraído foi mantido a temperatura de - 20oC até a avaliação por PCR. Os primers utilizados são relacionados com o gene invA e foram os seguintes: 5’ GTA AAA TTA TCG CCA CGT TCG GGC AA 3’ and 5’ TCA TCG CAC CGT CAA AGG AAC C 3’. Os produtos da amplificação foram vizualizados em transiluminador com luz ultravioleta. Os resultados obtidos demonstraram que o método de extração por partículas de sílica foi o mais eficiente, por obter um DNA de boa qualidade e quantidade suficiente para conseguir bons resultados na técnica de PCR.

The present study evaluated the efficiency of different protocols for the genomic DNA extraction of Salmonella bacteria in chicken eggs free of specific pathogens – SPF. Seventy-five eggs were used and divided into five groups with fifteen eggs each. Three of the five groups of eggs were inoculated with enteric Salmonella cultures. One of the five groups was inoculated with Escherichia coli bacterium culture. And another group of eggs was the negative control that received saline solution 0.85% infertile. The eggs were incubated on a temperature that varied from 20 to 25°C during 24, 48 and 72 hours. Five yolks of each group were collected every 24 hours. These yolks were homogenized and centrifuged during 10 minutes. The supernatant was rejected. After the discard, PBS ph 7.2 was added and centrifuged again. The sediment obtained of each group was used for the extraction of bacterial genomic DNA. Silica particles and a commercial kit were utilized as the extraction methods. The extracted DNA was kept on a temperature of 20°C until the evaluation through PCR. The primers utilized were related with the invA gene and they were the following: 5’ GTA AAA TTA TCG CCA CGT TCG GGC AA 3’ and 5’ TCA TCG CAC CGT CAA AGG AAC C 3’. The amplification products were visualized in transilluminator with ultraviolet light. The obtained results through the bacterial DNA extractions demonstrated that the extraction method utilizing silica particles was the most efficient because it obtained a DNA with good quality and sufficient quantity to get good results with the PCR technique.